Note, however, that FRAPS doesn't compress audio. You can cut down your files significantly if you re-encode them afterwards with MP3 audio compression. It will save a CHUNK of HD space. Trust me on that!
No.  Just keep them regular size until you do whatever video project you plan to do.  The audio only accounts for around 1% of the total file size.
Properties of a Fraps file of mine picked at random:
General
Complete name                  : D:\Fraps\Yak9TestLRearChase6.avi
Format                         : AVI
Format/Info                    : Audio Video Interleave
File size                      : 3.95 GiB
Duration                       : 2mn 17s
Overall bit rate               : 247 Mbps
Video
ID                             : 0
Format                         : Fraps
Codec ID                       : FPS1
Duration                       : 2mn 17s
Bit rate                       : 246 Mbps
Width                          : 1 680 pixels
Height                         : 1 050 pixels
Display aspect ratio           : 1.600
Frame rate                     : 30.000 fps
Bits/(Pixel*Frame)             : 4.643
Stream size                    : 3.93 GiB (99%)
Audio
ID                             : 1
Format                         : PCM
Format settings, Endianness    : Little
Format settings, Sign          : Signed
Codec ID                       : 1
Duration                       : 2mn 17s
Bit rate mode                  : Constant
Bit rate                       : 1 411.2 Kbps
Channel(s)                     : 2 channels
Sampling rate                  : 44.1 KHz
Bit depth                      : 16 bits
Stream size                    : 23.1 MiB (1%)
Interleave, duration           : 995 ms (29.86 video frames)